Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms