Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms