Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms