Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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