Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms