Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NECTIN3Q9NQS3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms