Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FANCFQ9NPI8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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