Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms