Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms