Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf72Q96LT7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms