Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms