Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms