Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELP4Q96EB1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms