Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG4Q92954 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms