Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOPBP1Q92547 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms