Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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