Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms