Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP4Q8N2S1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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