Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms