Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms