Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM176BQ3YBM2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms