Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms