Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms