Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FSCN1Q16658 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms