Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZFHX3Q15911 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZFHX3Q15911 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZFHX3Q15911 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZFHX3Q15911 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZFHX3Q15911 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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