Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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