Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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PTPRKQ15262 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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