Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARHGEF6Q15052 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARHGEF6Q15052 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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