Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NCAPHQ15003 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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