Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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