Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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