Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SPIDRQ14159 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SPIDRQ14159 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SPIDRQ14159 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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