Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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CNGB1Q14028 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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