Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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