Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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NR5A1Q13285 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR5A1Q13285 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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