Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms