Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXF1Q12946 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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