Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNTN1Q12860 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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