Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms