Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms