Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms