Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJA9P57773 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA9P57773 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms