Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPAP53621 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms