Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms