Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP4P49662 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms