Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNA7P36544 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms