Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms