Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCD1P33897 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCD1P33897 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCD1P33897 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCD1P33897 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD1P33897 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms