Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPS1P31327 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPS1P31327 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPS1P31327 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPS1P31327 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPS1P31327 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms