Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms